科技日报记者 乔地
今天，《天然-遗传学》以2篇长文（Research Article）情势在线颁发以中国农科院郑州果树研究所所为第一单元完成的“甜瓜变异组图谱揭露甜瓜屡次驯化事务及影响农艺性状的位点”，和配合第一作者单元“年夜范围基因组重测序揭露了西水果实品质与抗性的选择驯化过程”两篇论文。
两项研究别离构建了甜瓜和西瓜的全基因组变异图谱，揭露了两种生果的驯化汗青及果实品质的遗传份子机制。两项功效为西甜瓜种质资本研究供给新的理论框架和组学数据，也为西甜瓜份子育种供给了年夜量的基因资本和选择东西，具有主要科学价值和实践意义。上述功效的颁发将进一步强化我国在瓜类作物基因组学与份子育种范畴的国际领先地位。
该所徐永阳研究员其地点团队结合深圳农业基因组研究所、西班牙巴塞罗那食物科学院及青岛农业年夜学、中国农业科学院蔬菜花草研究所、中国农业年夜学、美国康奈尔年夜学、法国农业科学院等19个国表里科研机构，用时5年配合构建了世界第一个甜瓜全基因组变异图谱，初次系统阐释了甜瓜的复杂驯化汗青及主要农艺性状构成的遗传根本。甜瓜研究团队阐发了千余份甜瓜种质资本的基因组变异，共判定了560余万个SNP位点。在此根本上，发现甜瓜可能产生过三次自力的驯化事务，此中一次产生在非洲地域，别的两次产生在亚洲地域并别离发生了厚皮甜瓜和薄皮甜瓜两个栽培亚种。三次自力驯化“异曲同工”，都致使野生甜瓜掉往了苦味和酸味并取得了甜味。另外，经由过程全基因组联系关系阐发等手段，定位了200余个与甜瓜苦味、酸味、果实年夜小、果肉色彩等性状相干的候选基因和位点。中国农业科学院郑州果树研究所赵光伟、中国农业科学院深圳农业基因组研究所练群、青岛农业年夜学张忠华、中国农业科学院蔬菜花草研究所付秋实为论文配合第一作者。中国农业科学院深圳农业基因组研究所黄三文研究员、中国农业科学院郑州果树研究所徐永阳研究员与西班牙巴塞罗那农业基因组中间Jordi Garcia-Mas研究员为论文配合通信作者。
该所刘文革研究员其地点团队协同北京市农林科学院、美国康奈尔年夜学、深圳基因组所构成结合攻关团队，起首采取单份子测序、光学图谱与Hi-C三维基因组结合阐发，完成了高质量的西瓜基因组序列图谱。继而，对400多份种质资本展开了基因组变异阐发，共判定近2000万个SNP。在此根本上，初次明白了西瓜7个种之间的进化关系，发现野生黏籽西瓜是距现代栽培西瓜亲缘关系比来的种群，也发现了操纵野生西瓜进行抗性改进的基因组陈迹。另外，判定取得了与果实含糖量、瓤色、外形等性状联系关系的43个旌旗灯号位点，供给了关头候选基因。北京市农林科学院郭绍贵、中国农科院郑州果树所赵胜杰、北京农林科学院孙宏贺、美国康奈尔年夜学Boyce Thompson植物研究所王昕、美国康奈尔年夜学Boyce Thompson 植物研究所吴珊、中国农科院院蔬菜花草研究所林涛为论文配合第一作者。北京市农林科学院国度西甜瓜改进中间许勇研究员、中国农科院郑州果树所刘文革研究员、美国康奈尔年夜学Boyce Thompson研究所费章君传授、深圳农业基因组研究所黄三文研究员为本文配合通信作者。
上述两项研究遭到中国农科院科技立异工程、现代农业财产手艺系统、国度天然科学基金、国度重点研发打算、广东省珠江打算、深圳市孔雀打算和年夜鹏新区等帮助。
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