科技日报通信员衣晓峰宁尚伟记者李丽云
当前癌症的诊疗正进进个性化和精准化的极新时期，而生物医学年夜数据的呈现为恶性肿瘤的防治及机制摸索供给了史无前例的机缘。科技日报记者23日得悉，哈尔滨医科年夜学生物信息学院院长李霞传授及其团队在肿瘤年夜数据研究范畴获得了一系列新进展，他们周全整合和发掘了肿瘤生物医学年夜数据资本，从系统层面深切阐释了分歧份子致使肿瘤产生成长的奥秘地点，锁定了新的肿瘤生物标记物，开辟打造了新的评估和检测肿瘤医治反映的年夜数据平台。其系列论文从本年初到此刻，陆续颁发于国际闻名学术期刊《神经肿瘤学》《肝脏病学》《核酸研究》；相干功效前不久还取得了2019年国度教育部天然科学二等奖。
在多项国度天然科学基金帮助下，李霞传授团队操纵高通量的新一代测序数据和单核苷酸多态性芯片数据资本，成功辨别了约600例低阶胶质瘤和胶质瘤母细胞瘤病人的突变克隆状况，在克隆进化程度上解析了性别之间的差别；同时揭露了女性胶质瘤病人携带更高的整体和亚克隆突变负荷，辨识了显现出克隆性性别差别的闻名癌基因，如CDH18基因和ATRX基因，和胶质瘤的各个亚型、性别间闪现出的突变负荷和癌基因的克隆性差别。研究还发现，临床可靶向的基因突变如MAPK旌旗灯号通路、RTK旌旗灯号通路突变在性别间存在克隆状况差别，证实了在胶质瘤临床上应斟酌性别这一主要身分的需要性，这对胶质瘤的临床用药有必然的指点意义。
在另外一项研究中，李霞传授团队与德州年夜学奥斯汀分校专家合作，在癌症相干RNA连系卵白范畴获得了新冲破。该课题经由过程切磋RNA连系卵白的遗传改变模式，发现有害的突变偏向产生在RNA连系卵白的概况。经由过程构建卵白-RNA互作收集并对收集进行阐发，发现互作RNA连系卵白间调控原则，并对分歧癌症类型的RNA连系卵白-基因调控收集进行领会析。在对多种癌症中的“探秘”中，合作团队发现了癌细胞选择性的靶向“懦弱性”基因，以侵扰介入癌症功能的卵白-RNA相互感化。基于受干扰的RNA连系卵白和靶基因的表达，两国专家辨认出了具有分歧保存率的三种肝癌亚型，为研究肝癌中体细胞突变扰动卵白-RNA的调控收集和揭开癌症中基因型与表型关系，供给了有价值的资本及独到看法。
另外，为成立根本研究与临床医学之间的沟通桥梁，早日把学术功效推行光临床利用中，李霞传授团队还开辟了多个界面友爱、功能壮大、合适于科研职员利用的肿瘤生物医学年夜数据平台与阐发软件。他们颁发在《核酸研究》杂志上的最新版本Lnc2Cancer v2.0数据库，是全球最年夜的肿瘤相干长链非编码RNA数据库，今朝拜候量已接近12000次，并评为高被引论文。这一数据库存储了尝试证实的长链非编码RNA与癌症关系的数据资料，包罗癌症中轮回、耐药性和预后相干的长链非编码RNA，和肿瘤中遭到突变、DNA甲基化和转录因子调控的长链非编码RNA，并对相干癌症按照国际分类尺度进行了尺度化定名，以便利科技工作者按癌症原发位置和调控机制进行检索和数据下载。
据领会，李霞传授团队在863项目、973项目、科技部重年夜研究专项和国度天然科学基金等数十项课题的帮助下，在癌症相干的非编码RNA科研范畴获得了一系列主要功效，持续颁发影响因子年夜于10分的论文30余篇，部门文章被评为高被引论文，获得了《天然综述遗传学》等高影响力刊物的高度评价，研究功效取得了教育部天然科学奖、黑龙江当局科技奖、中华医学科技奖等主要嘉奖。李霞团队出格重点开辟操纵了当前丰硕的肿瘤生物医学年夜数据资本；修建了高效靠得住的算法系统预，用来测肿瘤相干非编码RNA标记物，并将其用于肿瘤病人的化疗药物挑选和个别化用药指点上。专家评价指出，上述系列功效从非编码RNA的全新视角，为肿瘤防治和机制研究，供给了肿瘤年夜数据撑持和信息挖掘的方式学参考。
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