科技日报记者 赵汉斌
年青、富有活力，这是良多人对云南农业年夜学传授董扬的第一印象。现在，这位80后传授，正率领一支均匀春秋26岁的科研团队破解全球葡萄遗传多样性和人工驯化机理。共有26国介入该研究，处置数据量达40Tb，这也是迄今为止全球最年夜的植物遗传资本研究项目之一。
“有国度作后援，还有强有力的人材和手艺作支持，获得功效，指日可待！”近日，董扬在接管科技日报记者采访时说。
曾是云南省最年青的传授
1984年11月，董扬诞生在陕西省宝鸡市。在武汉年夜学上学时，他操纵课余时候，来到中国科学院昆明动物研究所（以下简称昆明动物所）练习。随后，他又在该所完成硕、博阶段的进修。
读博时，董扬师从昆明动物所研究员王文，从果蝇的经典遗传研究进手，练足了尝试室工夫，为后来从事基因组研究打下了根本。
“我没在国外留过学，一向深耕于云南这片膏壤。”采访中，董扬屡次表达了本身“赶上”云南的荣幸。2011年，博士结业后，他从年夜理动身，骑车颠末怒江峡谷，进进西躲。在此时代，他领略到了生物的多样性，并深受震动。由此，他决议把挖掘这座宝库定为本身的研究标的目的。因而，昔时不到29岁的他，果断地走上了科研之路，成为那时云南最年青的传授。
尔后，董扬连系云南特点，着手进行了一系列遗传资本研究工作，并在药用植物基因组、山羊基因组等范畴，建起了从基因组学到功能基因组学的系列科研平台。
创制出基因组学的标记性手艺
读研时，董扬就接触过山羊基因组研究，这项研究一向延续到他加入工作。
“中国事世界第一年夜养羊国、第一年夜羊肉消费国和第一年夜羊绒出产国，但我们的羊财产成长还比力掉队，特别是在育种手艺上。”董扬说，因为山羊的育种周期长，所以要想实现山羊的快速育种，就必需取得高质量的基因组。
董扬操纵本土资本，选择了云南山羊品种——云岭黑山羊，并在2011年启动了基因组测序工作。这类羊通体黝黑，有很好的抗病性。
在山羊基因组测序中，董扬团队利用新一代测序手艺和最新DNA单份子光学作图手艺，降服测序中短读支架的局限，天生长超等支架，装配出的基因组接近染色体程度，取得了首个不依靠于遗传图谱的年夜型基因组。同时，他们操纵微量核糖核酸转录组手艺，初次周全揭露了山羊绒囊、毛囊在转录层面的差别，判定了50多个与山羊绒构成紧密亲密相干的基因。
另外，凭仗手艺上风，董扬团队把本来需要10年至15年时候完成的遗传图谱，缩至半年，相干功效颁发在《天然·生物手艺》杂志上。业界评论称，该手艺将成为基因组学成长的一项标记性手艺。
在此根本上，董扬又与国内高校、院所合作，完成了绒山羊的育种工作，使绒的产量、质量都获得敏捷晋升。
展转多地调试第三代测序仪
回首过往，最使董扬难忘的，是研究药用植物铁皮石斛基因组的履历。“那时石斛财产很火，老苍生对这类草药寄与脱贫厚看。但是，铁皮石斛基因组很是复杂，这个物种含有年夜量多糖，仅DNA提取就面对很年夜挑战。并且，我们用尽了所有第二代测序方式，都未到达很是好的组装结果。”他说。
那时，第三代测序手艺刚进进中国，全国只有三台相干仪器。但它们终年处于维修状况，利用本钱还很是高，测序质量也不不变。
工欲善其事，必先利其器。董扬率队展转于昆明、内蒙古等地，不竭对第三代测序仪进行参数优化，调剂仪器运行状况，还动用了“河汉一号”的计较资本。终究，他们完成了测序工作，测序成果笼盖95%的全基因组和97%的基因编码区。
“这一研究功效，不但为中国从基因程度阐发和拟定铁皮石斛尺度供给了科学根据，还加速了相干根本研究和利用开辟的进度。”云南农业年夜黉舍长盛军说。
经由过程进一步解析铁皮石斛的基因信息，董扬等人还发现了48000多个卵白质编码基因，从基因程度证实了铁皮石斛基因组的复杂性。“经由过程完成这个项目，我们团队堆集了三代测序的经验，为尔后的工作打下了根本。”董扬说。
尔后，董扬又率队前后展开了辣木、天麻、玛卡、灯盏花、三7、茶叶、丹参等一系列药用植物的基因组学研究工作。
“经由过程基因研究，我们让该范畴本来相对滞后的根本研究程度获得了较年夜晋升，并将科学功效与国际同业同享。”董扬说，世界各地的科学家也在操纵这些基因组，往研究物种形态的多样性，而且操纵这些基因序列来革新物种性状、造福人类。
中国科学院院士、华年夜基因研究院院长杨焕明告知科技日报记者，董扬是一名很是勤学且很有见识的青年科学家，已成为浩繁项目标领头人。他率队弄的药用植物4.0研究打算，已到达世界前沿程度。
“国力加强和对根本科研的正视，让中国对世界科研的引领感化日趋较着。国际同业对中国科学家的尊敬和信赖，也让我倍感高傲，我真是遇上了一个好时期！”董扬相信，将来在全球基因组学研究范畴，中国会阐扬更强的引领感化。
加载更多>>