马刺队在选中邓肯之后，围绕着邓肯建队，让马刺队在近20年内，都保持了不错的竞争力，很久没有抽到过乐透签了，有媒体统计了马刺队近三次拥有乐透签时的选秀情况，1987年，马刺队拥有乐透签，在第一顺位选中了大卫罗宾逊；1989年，在第三顺位选中了肖恩埃利奥特；1997年，在第一顺位选中了蒂姆邓肯。
对于马刺队所选的这三名乐透秀，大家比较熟悉的是大卫罗宾逊和邓肯，这两位给马刺队带来了很多的荣誉，其实，肖恩埃利奥特对马刺队的贡献也不小，也正因为肖恩埃利奥特的贡献很大，马刺队退役了肖恩埃利奥特的球衣，现在肖恩埃利奥特的球衣正悬挂在球馆上方。大学的辉煌，初入联助球队重返季后赛
上世纪90年代后，马刺成为了NBA联盟里的一支强队，一直延续到上个赛季，上个赛季马刺队还是季后赛球队，但在上世纪90年代之前，称马刺队为强队还差点意思，从85-86赛季到89-90赛季之前，马刺队共打进季后赛2次，在这2次季后赛之旅中，马刺队都止步于首轮。88-89赛季，马刺队的战绩为21胜61负，排在西部第八，全联盟第23，这个糟糕的战绩，让马刺队有了选乐透秀的机会，在1989年选秀大会上，马刺队在第三顺位选中了肖恩埃利奥特。
埃利奥特，是土生土长的亚利桑那州图森市人，在大学期间，埃利奥特就获得了不少荣誉，在结束自己大学生涯前，埃利奥特创造了Pac-10分区联赛历史上的得分最多的纪录，贾巴尔这一记录原先有贾巴尔保持，在大四时，埃利奥特获得了1989年的约翰伍登奖。
89-90赛季，对马刺队来说是一个不同寻常的赛季，在这个赛季，马刺队组建了一个很有竞争力的阵容。大卫罗宾逊在这个赛季归来，大卫罗宾逊早在1987年就被球队选中了，但因为罗宾逊要服兵役，所以罗宾逊在89-90赛季才开始为马刺队效力，只有罗宾逊还不能说马刺队组建了一个很有竞争力的阵容，此外，马刺队还交易来了全明星前锋特里卡明斯，有了罗宾逊和卡明斯再加上新秀埃利奥特，这三个人构成了马刺队阵容的主体。
新秀赛季的埃利奥特，表现得不错，场均出战25分钟，场均出手8次，能够拿到10分，此外还有3.7个篮板1.9个助攻，投篮命中率为48.1%，在这届新秀中，埃利奥特的表现是上乘的，在当赛季最佳新秀的评选中，埃利奥特入选了最佳新秀阵容第二阵容。在罗宾逊、卡明斯和埃利奥特等马刺队员的努力下，马刺队在常规赛取得了56胜26负的战绩，位列西部第二位，从西部第八，到西部第二，马刺队的进步非常大。在马刺队重返季后赛中，埃利奥特虽不是主角，但也贡献了自己的一分力量。成长为全明星后卫后，被球队交易至活塞
90-91赛季，埃利奥特坐稳了球队首发后卫的位子，成为了球队的外线主力，在这个赛季，埃利奥特打满了82场比赛，场均上场37.1分钟，是队内上场时间第二多的球员。
场均出手11.9次，能够贡献15.9分，此外还有5.6个篮板和2.9个助攻，得分仅次于罗宾逊和卡明斯，二年级的埃利奥特凭借着自己出色的表现成为了球队的三当家。
在此后的几个赛季中，埃利奥特的得分都在增长，篮板和助攻都保持在了一个水准，在出手次数增加的同时，埃利奥特还保持了同样水准的投篮命中率。
到了92-93赛季，埃利奥特场均贡献17.2分4.6个篮板3.8个助攻，得分是队内第二高，埃利奥特的出色发挥，让马刺队有了内外两个强点，在全明星票选中，埃利奥特入选了全明星了，成为了全明星级别的球员，在罗宾逊、卡明斯和埃利奥特的带领下，89-90赛季到92-93赛季这四个赛季，马刺队都闯进了季后赛，成为了季后赛的常客。
92-93赛季，马刺队将目光聚集到了活塞队的罗德曼身上，打算通过交易得到他，经过与活塞队的商讨，双方达成了这笔交易，马刺队将埃利奥特送至活塞队，得到了罗德曼。到了活塞队后，肖恩埃利奥特并没有延续自己在马刺队的精彩表现，反而被伤病缠身，表现不佳。伤病缠身后表现不佳，回归却打出生涯最佳表现
在被交易至活塞队后，埃利奥特没有延续自己在马刺队的出色表现，因为伤病找上了埃利奥特，埃利奥特的不佳表现让活塞队想把他交易走，活塞队的想用埃利奥特来换取火箭队的罗伯特霍里，但在体检中，埃利奥特被查出有慢性肾病，火箭队并不想换来一个病人，所以，这笔交易被火箭队取消了，埃利奥特要为活塞队继续打球。
这个赛季，埃利奥特出战了73场比赛，场均12.1分3.6个篮板2.7个助攻，投篮命中率为45.5%，比其上赛季来说，埃利奥特下滑的幅度比较大。身体状况不佳，让埃利奥特的职业生涯能否继续还不确定，但这时，马刺队决定交易回埃利奥特，在休赛期，马刺队用新秀比尔科尔利把埃利奥特交易回马刺队。
令人惊讶的是，埃利奥特回到马刺队后，仿佛换了一个人，不仅身体状态有好转，他的赛场表现也更好了，除了保持了自己的冲击力，埃利奥特还把自己的三分球能力练了出来，这个赛季，埃利奥特场均出手4.1次三分球，能够命中1.7个，命中率为40.8%，在赛季三分球命中率榜上，埃利奥特排在第十五位，成为了联盟一流射手。
94-95赛季，埃利奥特场均能够贡献18.1分3.5个篮板2.5个助攻1个抢断，延续了自己在马刺队的上升势头，埃利奥特的归来，让马刺队再次拥有内外两个强点的配置，在常规赛，马刺队打出了62胜20负的战绩，位列西部第一，从85-86赛季算起，这是马刺队第一次登顶西部。
95-96赛季，埃利奥特势头不减，表现又有提升，赛季出战了77场比赛，场均贡献20分5.1个篮板2.7个助攻，三分球依旧精准，场均出手三分球5.1次，命中率为41.1%，在当赛季三分球命中率榜上，排在第17位。这个赛季是埃利奥特表现最好的一个赛季，既可以突破，也有外线投射的能力，是埃利奥特个人能力最强的一个赛季。
巅峰过后，往往就是就是低谷，不过埃利奥特的低谷来的有些快，95-96赛季表现出彩的埃利奥特，到了96-97赛季，表现得就一般了，原因是，埃利奥特又被伤病找上了，这次让埃利奥特表现不好的伤病是慢性右四头肌肌腱炎，在97年2月18日，埃利奥特决定接受手术治疗，因此，埃利奥特赛季报销了。96-97赛季，埃利奥特只打了39场比赛，场均贡献14.9分4.9个篮板3.2个助攻。97-98赛季，埃利奥特的表现更差了些，场均只得到了9.3分3.4个篮板1.7个助攻。高难度进球缔造奇迹，屡次冲冠终获冠军
98-99赛季，埃利奥特的表现有些回暖了，常规赛出战了50场比赛，场均贡献11.2分4.3个篮板2.3个助攻。
在季后赛，埃利奥特的表现也不错，整个季后赛场均贡献11.9分3.4个篮板2.6个助攻，是队内得分第三多的人，在与开拓者队的系列赛中，埃利奥特打出了自己生涯的代表作。
在98-99赛季，马刺队排在西部第一，开拓者队排在西部第三，两队在西部决赛相遇，第一场比赛，马刺队拿下了，将大比分改写为1-0，第二场比赛，开拓者队打的很出色，在终场前9.9秒时，开拓者队还领先2分，马刺队想赢，就得命中三分球，当时，波波维奇叫了暂停布置了战术。
回到场上，马里奥艾利发球，埃利奥特从罚球线跑出来，到三分线上接到了球，由于开拓者队员上前抢球，这球接的并不舒服，但埃利奥特对位置的判断非常准，他调整之后，用脚尖踩地，脚跟悬空，完成了出手，球在空中飞行了1秒多，落在了篮筐里，这记三分球将比分改写为85-86，虽然比赛还有9秒结束，但开拓者队并没有得分，最后比赛以马刺队一分险胜而结束。
这场失利对开拓者队打击很大，在进入第四节前，他们都是领先的。这场失利过后，开拓者队仿佛泄了气的皮球，斗志没有那么盛了，第三场比赛，马刺队赢了22分，第四场比赛马刺队赢了14分，随着两场大胜，马刺队横扫了开拓者队，闯进了总决赛，马刺队4-1战胜了尼克斯，夺得了总冠军。此前，埃利奥特打了6次季后赛，但都没有拿到总冠军，这次他拿到了，圆了自己的冠军梦。换肾后出战71场比赛，赢得"超人"的绰号
在马刺队夺冠后，埃利奥特的肾病日渐恶化，必须接受移植手术，他的哥哥为了让埃利奥特活下去，捐出了一个肾，99年8月16日，埃利奥特进行了肾移植手术，手术做的很成功。在休养了7个月后，埃利奥特回归了赛场，埃利奥特的回归让所有人惊讶，当埃利奥特要回归时，波波维奇开始都不同意，直到看了医生开出的证明后，波波维奇才把心放下，让埃利奥特归队，回归后的埃利奥特，打了两个赛季，共71场比赛。复出后的埃利奥特赢了"超人"的绰号。
2001年，埃拉奥特宣布退役，结束了自己传奇的NBA生涯。埃利奥特的职业生涯并不长，只有12年，但考虑到其在生涯中期就被查出肾病，能够打12年，也是不容易了，尤其是换肾后，还要出战更显示出了其对篮球的热爱。12年的职业生涯，埃利奥特常与伤病斗争，但埃利奥特始终没被伤病打垮，他的这股精神值得我们敬佩！