2019年12月在湖北武汉爆发了一种新型冠状病毒（SARS-CoV-2）而至的肺炎（现称COVID-19），新型冠状病毒爆发已经两个多月，肯定华南海鲜市场是否是独一的发祥地，对付寻觅病毒的来历，和肯定中心宿主，对疫情的节制以及防止再次爆发具备相当首要的意义。中国迷信院西双版纳暖带动物园联合华南农业年夜学以及北京脑科中间的科研职员一块儿采集了全球各畛域同享到GISAID EpiFluTM数据库中笼盖了四年夜洲12个国度的93个新型冠状病毒样本的基因组数据（截至2月12日），经由过程全基因组数据解析，追溯沾染源及分散途径。
研究发明，收到的93个样本包括58种单倍型，可以回纳为五组，包含3个古老超等传布者单倍型（H1,H3以及H13）以及2个新的超等传布者单倍型（H56以及mv2）；华南海鲜市场的新型冠状病毒是从其余处所传进入来，在市场中产生疾速传布舒展到市场以外；同时，现分散的病例至少来自于3个路径。新型冠状病毒在2月12日以前产生过2次较着的种群扩张（分别是2019年12月8日以及1月6日）。
华南海鲜市场的病毒是从其余处所传进的
基于120个变异位点获得58种单倍型（基因类型），单倍型演化瓜葛显示，单倍型H13以及H38是比力“古老的”单倍型，经由过程一个中心载体（mv1，多是一个先人单倍型，多是来自中心宿主或者者“零号病人”）与蝙蝠冠状病毒RaTG13联系关系，并经由过程单倍型H3衍生出了单倍型H1。
与华南海鲜市场无关联的患者样品单倍型都是H1及其衍生的单倍型H2，H8-H12，而一份武汉样品单倍型H3与华南海鲜市场有关。可见，华南海鲜市场的新型冠状病毒是从其余处所传进入来，在市场中产生疾速传布舒展到市场以外。另外，凭据病患病发时间记实以及种群扩张时间揣度，也印证了华南海鲜市场不是病毒发祥地的推论。
对“古老的”单倍型H13以及H38的病毒样品溯源发明分别是来自深圳的病患（广东首例）以及美国华盛顿州的病患（美国首例）。他们的旅行记实评释应当都是2019年12月尾至2020年1月初在武汉省亲时代被熏染的。现有武汉样本中没有检测到H13以及H38单倍型，多是由于现有样品次要采自几家定点病院，并且样品收集时间局限于2019年12月24日以及2020年1月5日。若是能在武汉其余病院初期的病患检测到这两种单倍型，将对付寻觅病毒来历很是有匡助。
病毒在2月12日以前
产生过2次较着种群扩张
凭据新型冠状病毒基因组数据推算1月以前的种群扩张产生时间是2019年12月8日，该效果表示病毒可能在12月初，乃至11月下旬即已经经起头有人际传布，随后在华南海鲜市场加速了人际传布。研究推算2月份以前的种群扩张时间在1月6日，这个可能与元旦假期无关联。
必要指出，这一天堂家疾控中间发布了2级应急相应。那时的预警起到了一些警示作用，公家勾当以及出行都有所削减。若是那时的警示能引发年夜众更普遍的器重，那末1月份中下旬向天下以及全世界舒展的病例会有所下降。研究职员入一步确认我国其余9个省区以及其余11个国度的熏染病例根基都是从武汉间接或者者直接输出而来。
现分散的病例至少来自于3个路径
为了可以或许细分来历，研究职员将58种单倍型分红了五组，采纳尺度是3个中间（古老超等传布者）单倍型（H1,H3以及H13）以及2个新的超等传布者单倍型（H56以及mv2）。以此甄别出广东的病毒可能有三个来历，重庆以及台湾的病毒有两个来历。
此中，广东深圳一家人在初期就经由过程人传人入行了传布。有较多样本的澳年夜利亚、法国、日本以及美国，它们的患者熏染源至少有两个，尤为是美国包含了五个来历。很是值患上存眷的是H56这个超等传布者单倍型，它同时是澳年夜利亚、法国以及美国，和我国台湾患者的沾染源。其余国度患者由于样品比力少，年夜大都的来历比力繁多，他们除了了是武汉游览输出或者在武汉熏染外，有一些人多是在广东、新加坡等地被熏染。