科技日报记者 赵汉斌 通信员 赵若苹
凤蝶科是具有主要进化地位的胡蝶支系,因其丰硕的色采和形态等多样性,是虫豸生态与进化研究的热点主题。记者19日从中科院昆明动物研究所得悉,该所进化基因组学与基因发源研究组近日发布了中华碧凤蝶染色体程度基因组。按照所构建的进化树提醒,这类斑斓的物种竟发源于约五万万年前。
中科院昆明动物研究所进化基因组学与基因发源研究组图
胡蝶因其丰硕的形态多样性,自达尔文时期就作为研究物种顺应性进化的主要类群之一,近几年更被以为是研究形态遗传、进化和发育的抱负模子,已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、庇护生物学和生态学等研究范畴的主要模式生物之一。
李学燕副研究员先容,研究组曾在2015年完成所有胡蝶模式种金凤蝶及其近缘种柑桔凤蝶两种凤蝶基因组的根本上,对普遍散布在东亚、南亚和东南亚并对体色进化及物种分化具有主要研究意义的碧凤蝶进行了基因组研究。他们应用三代长读长测序手艺,连系高通量染色体构象捕捉手艺,成功地组装了碧凤蝶染色体程度的基因组,共有29条常染色体和1条性染色体。这也是首个操纵高通量染色体构象捕捉手艺完成的染色体程度的胡蝶基因组,其总长约为421.52 Mb。基因组注释的成果表白,这是所有已颁发的胡蝶基因组中反复序列最高的基因组,注释到的卵白编码基因共15375个。
研究职员操纵4D位点和直系同源基因构建的进化树还提醒,凤蝶属发源于3900万年至5700万年之间,它与柑桔凤蝶和金凤蝶的不合约在两至三万万年间。经由过程对碧凤蝶的汗青种群动态进行阐发成果显示,碧凤蝶种群从比来的一次间冰期起头增添,直至末次盛冰期为止,这与先前对其他虫豸的研究成果一致。
碧凤蝶染色体程度的参考基因组不但为研究碧凤蝶特别生物学特征的遗传和份子机制奠基了根本,也为凤蝶、甚至全部胡蝶资本开辟和生物多样性庇护供给了根本资料。此项研究以“基于第三代DNA测序和Hi-C阐发的中华碧凤蝶染色体程度参考基因组”为题,颁发在华年夜基因年夜数据期刊GigaScience上。
加载更多>>